La biblioteca de la Fundación consta aproximadamente de 42.650 monografías.

Estos fondos están repartidos temáticamente por las salas de la Fundación.

A la obra de CJC están dedicadas las siguientes salas:

·        Sala de Pascual Duarte I y II, con la exposición permanente de sus ediciones (en 37 idiomas distintos) y del facsímil del manuscrito.

·        Sala de La colmena, sala dedicada dicha obra y a sus ediciones (en 23 idiomas).

·        Sala de la Novela de CJC, exposición dedicada a las obra novelística del autor y a sus ediciones.

·        Sala de Papeles de Son Armadans, El Extramundi y los Papeles de Iria Flavia y de la Editorial Alfaguara.

·        Sala de Viajes, con la exposición permanente de los 17 libros de viajes del autor y del facsímil del manuscrito de Viaje a la Alcarria.